长崎纯心大学，是于1934年建立，1994年设立大学部的日本私立大学。
长崎短期大学以“高素质，高修养”“坚强意志，健康体魄”为宗旨，重视日本引以为豪的茶道文化教育。以“以人为本 ”的思想传承茶道精神。
长崎县立大学作为一所县立大学，取长崎的历史、文化、地理之长，在为发展地方经济、提高县民的健康、生活和文化水平方面发挥着学术和文化上的核心作用。
长崎综合科学大学创建于1942年，是一座有历史和传统的私立大学。
长崎国际大学(ナガサキコクサイだいがく、英文名称：Nagasaki International University)学校创办于2000年,是一所私立大学。
长崎外国语大学的前身叫做长崎外国语学校，本着祈求人类和平与共存的基督教精神创立于1945年。
长崎卫斯理公会大学的前身是镇西学院短期大学，它由成立于1881年的学校法人镇西学院於1966年创办的。
1879年以女子学校的形式设立了活水学院。校名“活水”二字，取自约翰福音书第4音14节，从泉源涌出的水，喻意学院的发展源源不断。
长崎大学最早起源于1857年设立的医学传习所。1949年5月31日，根据国立学校设置法，设立了作为综合大学的新制长崎大学，2004年4月，长崎大学成为国立大学法人，开始了新的征程。
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